Kniga-Online.club
» » » » Несса Кэри - Мусорная ДНК. Путешествие в темную материю генома

Несса Кэри - Мусорная ДНК. Путешествие в темную материю генома

Читать бесплатно Несса Кэри - Мусорная ДНК. Путешествие в темную материю генома. Жанр: Биология издательство -, год 2004. Так же читаем полные версии (весь текст) онлайн без регистрации и SMS на сайте kniga-online.club или прочесть краткое содержание, предисловие (аннотацию), описание и ознакомиться с отзывами (комментариями) о произведении.
Перейти на страницу:

2. Vlangos CN, Siuniak AN, Robinson D, Chinnaiyan AM, Lyons RH Jr, Cavalcoli JD, Keegan CE. Next-generation sequencing identifies the Danforth’s short tail mouse mutation as a retrotransposon insertion affecting Ptf1a expression. PLoS Genet. 2013;9(2):e1003205.

3. Bogdanik LP, Chapman HD, Miers KE, Serreze DV, Burgess RW. A MusD retrotransposon insertion in the mouse Slc6a5 gene causes alterations in neuromuscular junction maturation and behavioral phenotypes. PLoS One. 2012;7(1):e30217.

4. Schneuwly S, Klemenz R. Gehring WJ. Redesigning the body plan of Drosophila by ectopic expression of the homeotic gene Antennapedia. Nature. 1987 Feb 26 — Mar 4;325(6107):816-8.

5. Mortlock DP, Post LC, Innis JW. The molecular basis of hypodactyly (Hd): a deletion in Hoxa 13 leads to arrest of digital arch formation. Nat Genet. 1996 Jul; 13(3):284-9.

6. Rowe HM, Jakobsson J, Mesnard D, Rougemont J, Reynard S, Aktas T, Maillard PV, Layard-Liesching H, Verp S, Marquis J, Spitz F, Constam DB, Trono D. KAP1 controls endogenous retroviruses in embryonic stem cells. Nature. 2010 Jan 14;463(7278):237-40.

7. Young GR, Eksmond U, Salcedo R, Alexopoulou L, Stoye JP, Kassiotis G. Resurrection of endogenous retroviruses in antibody-deficient mice. Nature. 2012 Nov 29;491(7426):774-8.

8. http://www.emedicinehealth.com/heart_and_lung_transplant/article_em.htm

9. Недавно вышел интересный обзор, посвященный ксенотрансплантации: Cooper DK. A brief history of cross-species organ transplantation. Proc (Bayl Univ Med Cent). 2012 Jan; 25(1):49-57.

10. Patience C, Takeuchi Y, Weiss RA. Infection of human cells by an endogenous retrovirus of pigs. Nat Med. 1997 Mar; 3(3):282-6.

11. Di Nicuolo G, D’Alessandro A, Andria B, Scuderi V, Scognamiglio M, Tammaro A, Mancini A, Cozzolino S, Di Florio E, Bracco A, Calise F, Chamuleau RA. Long-term absence of porcine endogenous retrovirus infection in chronically immunosuppressed patients after treatment with the porcine cell-based Academic Medical Center bioartificial liver. Xenotransplantation. 2010 Nov — Dec; 17(6):431-9.

12. Недавно появился полезный обзор исследований эффектов такого удвоения сегментов генетического материала, в том числе и при аномальном кроссинговере: Rudd МК, Keene J, Bunke В, Kaminsky ЕВ, Adam MP, Mulle JG, Ledbetter DH, Martin CL. Segmentai duplications mediate novel, clinically relevant chromosome rearrangements. Hum Mol Genet. 2009 Aug 15;18(16):2957-62.

13. Подробнее об этом заболевании и его причинах см. в: http:// www.ninds.nih.gov/disorders/charcot_marie_tooth/detail_charcot_marie_tooth.htm.

14. Подробнее об этом заболевании и его причинах см. в: http:// www.nlm.nih.gov/mediineplus/ency/article/001116.htm.

15. Mombaerts Р. The human repertoire of odorant receptor genes and pseudogenes. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2001;2:493-510.

16. http://www.innocenceproject.org/know, по состоянию на 1 января 2014.

Глава 5

1. Сведения о сборах даются по: http://www.imdb.com.

2. Цит. по: Boxer LM, Dang CV. Translocations involving c-myc and c-myc function. Oncogene. 2001 Sep 20(40):5595-610.

3. Moyzis RK, Buckingham JM, Cram LS, Dani M, Deaven LL, Jones MD, Meyne J, Ratliff RL, Wu JR. A highly conserved repetitive DNA sequence, (TTAGGG) n, present at the telomeres of human chromosomes. Proc Natl Acad Sci USA. 1988 Sep; 85(18):6622-6.

4. Vaziri H, Schächter F, Uchida I, Wei L, Zhu X, Effros R, Cohen D, Harley CB. Loss of telomeric DNA during aging of normal and trisomy 21 human lymphocytes. Am J Hum Genet. 1993 Apr; 52(4):661-7.

5. Hayfick L, Moorhead PS. The serial cultivation of human diploid cell strains. Exp Cell Res. 1961 Dec; 25:585-621.

6. Harley CB, Futcher AB, Greider CW. Telomeres shorten during ageing of human fibroblasts. Nature. 1990 May 31;345(6274):458-60.

7. Bodnar AG, Ouellette M, Frolkis M, Holt SE, Chiu CP, Morin GB, Harley CB, Shay JW, Lichtsteiner S, Wright WE. Extension of life-span by introduction of telomerase into normal human cells. Science. 1998 Jan 16;279(5349):349-52.

8. Полезное обсуждение проблемы см. в: Armanios M, Blackburn EH. The telomere syndromes. Nat Rev Genet. 2012 Oct; 13(10):693-704.

9. Полезный обзор см. в: Armanios М, Blackburn EH. The telomere syndromes. Nat Rev Genet. 2012 Oct; 13(10):693-704.

10. Wright WE, Piatyszek MA, Rainey WE, Byrd W, Shay JW. Telomerase activity in human germline and embryonic tissues and cells. Dev Genet. 1996;18(2):173-9.

11. Kim NW, Piatyszek MA, Prowse KR, Harley CB, West MD, Ho PL, Coviello GM, Wright WE, Weinrich SL, Shay JW. Specific association of human telomerase activity with immortal cells and cancer. Science. 1994 Dec 23;266(5193):2011-5.

12. http://www.nlm.nih.gov/medlineplus/ency/anatomyvideos/000104.htm.

13. Chiu CP, Dragowska W, Kim NW, Vaziri H, Yui J, Thomas ТЕ, Harley CB, Lansdorp PM. Differential expression of telomerase activity in hematopoietic progenitors from adult human bone. Stem Cells. 1996 Mar; 14(2):239-48.

14. Vaziri H, Dragowska W, Allsopp RC, Thomas ТЕ, Harley CB, Lansdorp PM. Evidence for a mitotic clock in human hematopoietic stem cells: loss of telomeric DNA with age. Proc Natl Acad Set USA. 1994 Oct ll;91(21):9857-60.

15. Armanios M, Blackburn EH. The telomere syndromes. Nat Rev Genet. 2012 Oct; 13(10):693-704.

16. Armanios M, Blackburn EH. The telomere syndromes. Nat Rev Genet. 2012 Oct; 13(10):693-704.

17. Отличное клиническое описание и полезные иллюстрации см. в: Calado RT, Young NS. Telomere diseases. N Engl J Med. 2009 Dec 10;361(24):2353-65.

18. Alder JK, Chen JJ, Lancaster L, Danoff S, Su SC, Cogan JD, Vulto I, Xie M, Qi X, Tuder RM, Phillips JA 3rd, Lansdorp PM, Loyd JE, Armanios MY. Short telomeres are a risk factor for idiopathic pulmonary fibrosis. Proc Natl Acad Sci USA. 2008 Sep 2;105(35):13051-6.

19. Armanios MY, Chen JJ, Cogan JD, Alder JK, Ingersoll RG, Markin C, Lawson WE, Xie M, Vulto I, Phillips JA 3rd, Lansdorp PM, Greider CW, Loyd JE. Telomerase mutations in families with idiopathic pulmonary fibrosis. N Engl J Med. 2007 Mar 29;356(13):1317-26.

20. Tsakiri KD,CronkhiteJT, Kuan PJ, XingC, RaghuG, Weissler JC, Rosenblatt RL, Shay JW, Garcia CK. Adult-onset pulmonary fibrosis caused by mutations in telomerase. Proc Natl Acad Sei USA. 2007 May 1;104(18):7552-7.

21. Cronkhite JT, Xing C, Raghu G, Chin KM, Torres F, Rosenblatt RL, Garcia CK. Telomere shortening in familial and sporadic pulmonary fibrosis. Am J Respir Crit Care Med. 2008 Oct 1;178(7):729-37.

22. Полезное описание см. в: see http://www.patient.co.uk/doctor/aplastic-anaemia.

23. de la Fuente J, Dokal I. Dyskeratosis congenita: advances in the understanding of the telomerase defect and the role of stem cell transplantation. Pediatr Transplant. 2007 Sep; 11(6):584-94.

24. Armanios M, Chen JL, Chang YP, Brodsky RA, Hawkins A, Griffin CA, Eshleman JR, Cohen AR, Chakravarti A, Hamosh A, Greider CW. Haploinsufficiency of telomerase reverse transcriptase leads to anticipation in autosomal dominant dyskeratosis congenita. Proc Natl Acad Sci USA. 2005 Nov 1;102(44):15960-4.

25. http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs339/en.

26. Alder JK, Guo N, Kembou F, Parry EM, Anderson CJ, Gorgy AI, Walsh MF, Sussan T, Biswal S, Mitzner W, Tuder RM, Armanios M. Telomere length is a determinant of emphysema susceptibility. Am J Respir Crit Care Med. 2011 Oct 15;184(8):904-12.

27. Цит. no: Sahin E, Depinho RA. Linking functional decline of telomeres, mitochondria and stem cells during ageing. Nature. 2010 Mar 25;464(7288):520-528.

28. Статистика дается по данным American Heart Association on Older Americans & Cardiovascular Diseases (Американской ассоциации изучения сердца пожилых американцев и сердечно-сосудистых заболеваний), 2013.

29. http://www.rcpsych.ac.uk/healthadvice/problemsdisorders/depressioninolderadults.aspx.

30. Valdes AM, Andrew T, Gardner JP, Kimura M, Oelsner E, Cherkas LF, Aviv A, Spector TD. Obesity, cigarette smoking, and telomere length in women. Lancet. 2005 Aug 20-26;366(9486):662-4.

31. Cawthon RM, Smith KR, O’Brien E, Sivatchenko A, Kerber RA. Association between telomere length in blood and mortality in people aged 60 years or older. Lancet. 2003 Feb 1;361(9355):393-5.

32. Fitzpatrick AL, Kronmal RA, Kimura M, Gardner JP, Psaty BM, Jenny NS, Tracy RP, Hardikar S, Aviv A. Leukocyte telomere length and mortality in the Cardiovascular Health Study. J Gerontol A Biol Sci MedSci. 2011 Apr; 66<4):421-9.

33. Atzmon G, Cho M, Cawthon RM, Budagov T, Katz M, Yang X, Siegel G, Bergman A, Huffman DM, Schechter CB, Wright WE, Shay JW, Barzilai N, Govindaraju DR, Suh Y. Evolution in health and medicine Sackler colloquium: Genetic variation in human telomerase is associated with telomere length in Ashkenazi centenarians. Proc Natl Acad Sci USA. 2010 Jan 26;107 Suppl 1:1710-7.

34. Segerstrom SC, Miller GE. Psychological stress and the human immune system: a meta-analytic study of 30 years of inquiry. Psychol Bull. 2004 Jul; 130(4):601-30.

35. Epel ES, Blackburn EH, Lin J, Dhabhar FS, Adler NE, Morrow JD, Cawthon RM. Accelerated telomere shortening in response to life stress. Proc Natl Acad Sci USA. 2004 Dec 7; 101(49): 17312-5.

36. http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs311/en/index.html.

37. Полезное введение в эту область см. в: Tennen RI, Chua KF. Chromatin regulation and genome maintenance by mammalian SIRT6. Trends Biochem Sci. 2011 Jan; 36(l):39-46.

38. Valdes AM, Andrew T, Gardner JP, Kimura M, Oelsner E, Cherkas LF, Aviv A, Spector TD. Obesity, cigarette smoking, and telomere length in women. Lancet. 2005 Aug 20-26;366(9486):662-4.

39. UNFPA report on Ageing in The Twenty-First Century (Доклад Фонда ООН в области народонаселения «Старение в XXI веке»), 2012.

40. Jennings BJ, Ozanne SE, Dorling MW, Hales CN. Early growth determines longevity in male rats and may be related to telomere shortening in the kidney. FEBS Lett. 1999 Apr 1;448(1):4-8.

Глава 6

1. Из: The King and I («Король и я»), 1956, автор сценария Ernest Lehman, 20th Century Fox.

2. Хороший обзор типов центромер различных ветвей эволюционного древа см. в: Ogiyama Y, Ishii К. The smooth and stable operation of centromeres. Genes Genet Syst. 2012;87(2):63-73.

3. Полезный обзор: Verdaasdonk JS, Bloom K. Centromeres: unique chromatin structures that drive chromosome segregation. Nat Rev Mol Cell Biol. 2011 May; 12(5):320-32.

4. Palmer DK, O’Day K, Wener MH, Andrews BS, Margolis RL. A 17-kD centromere protein (CENP-A) copurifies with nucleosome core particles and with histones. J Cell Biol. 1987 Apr; 104(4):805-15.

5. Takahashi К, Chen ES, Yanagida M. Requirement of Mis6 centromere connector for localizing a CENP-A-like protein in fission yeast. Science. 2000 Jun 23;288(5474):2215-9.

6. Blower MD, Karpen GH. The role of Drosophila CID in kinetochore formation, cell-cycle progression and heterochromatin interactions. Nat Cell Biot. 2001 Aug; 3(8):730-9.

7. Hori T, Amano M, Suzuki A, Backer CB, Welburn JP, Dong Y, McEwen BF, Shang WH, Suzuki E, Okawa K, Cheeseman IM, Fukagawa T. CCAN makes multiple contacts with centromeric DNA to provide distinct pathways to the outer kinetochore. Cell. 2008 Dec 12;135(6):1039-52.

8. Heun P, Erhardt S, Blower MD, Weiss S. Skora AD, Karpen GHïf-Mislocalization of the Drosophila centromere-specific histone CID promotes formation of functional ectopic kinetochores. Dev Cell. 2006 Mar; 10(3):303-15.

9. Van Hooser AA, Ouspenski II, Gregson HC, Starr DA, Yen TJ, Goldberg ML, Yokomori K, Earnshaw WC, Sullivan KF, Brinkley BR. Specification of kinetochore-forming chromatin by the histone H3 variant CENP-A. J Cell Sci. 2001 Oct; 114(Pt 19):3529-42.

10. Zuccolo M, Alves A, Galy V, Bolhy S, Formstecher E, Racine V, Sibarita JB, Fukagawa T, Shiekhattar R, Yen T, Doye V. The human Nupl07-160 nuclear pore subcomplex contributes to proper kinetochore functions. EMBO J. 2007 Apr 4;26(7): 1853-64.

11. Palmer DK, O’Day K, Wener MH, Andrews BS, Margolis RL. A 17-kD centromere protein (CENP-A) copurifies with nucleosome core particles and with histones. J Cell Biol. 1987 Apr; 104(4):805-15.

12. Sekulic N, Bassett EA, Rogers DJ, Black BE. The structure of (CENP-A-H4) (2) reveals physical features that mark centromeres. Nature. 2010 Sep 16;467(7313):347-51.

13. Warburton PE, Cooke CA, Bourassa S, Vafa O, Sullivan BA, Stetten G, Gimelli G, Warburton D, Tyler-Smith C, Sullivan KF, Poirier GG, Earnshaw WC. Immunolocalization of CENP-A suggests a distinct nucleosome structure at the inner kinetochore plate of active centromeres. Curr Biol. 1997 Nov 1;7(11):901-904.

14. Очень хороший анализ этой модели см. в: Sekulic N, Black BE. Molecular underpinnings of centromere identity and maintenance. Trends Biochem Sci. 2012 Jun; 37(6):220-229.

Перейти на страницу:

Несса Кэри читать все книги автора по порядку

Несса Кэри - все книги автора в одном месте читать по порядку полные версии на сайте онлайн библиотеки kniga-online.club.


Мусорная ДНК. Путешествие в темную материю генома отзывы

Отзывы читателей о книге Мусорная ДНК. Путешествие в темную материю генома, автор: Несса Кэри. Читайте комментарии и мнения людей о произведении.


Уважаемые читатели и просто посетители нашей библиотеки! Просим Вас придерживаться определенных правил при комментировании литературных произведений.

  • 1. Просьба отказаться от дискриминационных высказываний. Мы защищаем право наших читателей свободно выражать свою точку зрения. Вместе с тем мы не терпим агрессии. На сайте запрещено оставлять комментарий, который содержит унизительные высказывания или призывы к насилию по отношению к отдельным лицам или группам людей на основании их расы, этнического происхождения, вероисповедания, недееспособности, пола, возраста, статуса ветерана, касты или сексуальной ориентации.
  • 2. Просьба отказаться от оскорблений, угроз и запугиваний.
  • 3. Просьба отказаться от нецензурной лексики.
  • 4. Просьба вести себя максимально корректно как по отношению к авторам, так и по отношению к другим читателям и их комментариям.

Надеемся на Ваше понимание и благоразумие. С уважением, администратор kniga-online.


Прокомментировать
Подтвердите что вы не робот:*
Подтвердите что вы не робот:*