Мир до нас: Новый взгляд на происхождение человека - Хайэм Том

318

Pearce, E. 2018. Neanderthals and Homo sapiens: Cognitively Different Kinds of Human? In L. D. Di Paolo, F. Di Vincenzo and F. De Petrillo (eds.), Evolution of Primate Social Cognition, Cham: Springer, pp. 181–96.

319

Vaesen, K. et al. 2019. Inbreeding, Allee Effects and Stochasticity Might be Sufficient to Account for Neanderthal Extinction. PLoS ONE 14(11): e0225117.

320

Kolodny, O. and Feldman, M. W. 2017. A Parsimonious Neutral Model Suggests Neanderthal Replacement was Determined by Migration and Random Species Drift. Nature Communications 8: 1040.

321

Simonti, C. N. et al. 2016. The Phenotypic Legacy of Admixture Between Modern Humans and Neandertals. Science 351: 737–41.

322

У Biobank имеется онлайн-база данных: http://geneatlas.roslin.ed.ac.uk/, в которой посетители могут найти определенные фенотипы и изучить результаты полногеномного поиска ассоциаций для более чем 30 млн генетических вариантов. Canela-Xandri, O., Rawlik, K. and Tenesa, A. 2018. An Atlas of Genetic Associations in UK Biobank. Nature Genetics 50: 1593–9.

323

Dannemann, M. and Kelso, J. 2017. The Contribution of Neanderthals to Phenotypic Variation in Modern Humans. American Journal of Human Genetics 101(4): 578–89.

324

Lalueza-Fox, C. et al. 2007. A Melanocortin 1 Receptor Allele Suggests Varying Pigmentation Among Neanderthals. Science 318: 1453–5.

325

Robles, C. et al. 2020. The Impact of Neanderthal Admixture on the Genetic Architecture of Complex Traits. Статья находится на стадии рецензирования/отправки в научное издание.

326

Pearce, E. 2013. The Effects of Latitude on Hominin Social Network Maintenance. Неопубликованная докторская диссертация по философии, Oxford University.

327

Sankararaman, S. et al. 2014. The Genomic Landscape of Neanderthal Ancestry in Present-Day Humans. Nature 507: 354–7.

328

Средством «доставки» диабета II типа является белок, переносящий определенные липиды или жирные кислоты в печень. В 2014 г. консорциум Slim Initiative in Genomic Medicine for the Americas (SIGMA) опубликовал результаты исследования, которое охватило более 8200 мексиканцев и жителей других стран Латинской Америки. Было установлено, что наличие двух генов, кодирующих белки (SLC16A11 и SLC16A13), существенно коррелирует с заболеваемостью диабетом II типа (у латиноамериканцев присутствует примерно такая же доля неандертальской ДНК, что и у жителей Евразии). Различные уровни белка SLC16A11 определяют наличие у человека типа жира, связанного с заболеванием. SIGMA Type 2 Diabetes Consortium, Williams, A. L. et al. 2014. Sequence Variants in SLC16A11 are a Common Risk Factor for Type 2 Diabetes in Mexico. Nature 506(7486): 97–101.

329

Fu, Q. et al. 2016. The Genetic History of Ice Age Europe. Nature 534: 200–205.

330

Petr, M. et al. 2019. Limits of Long-Term Selection Against Neandertal Introgression. Proceedings of the National Academy of Sciences 116(5): 1639–44.

331

Gunz, P. et al. 2019. Neandertal Introgression Sheds Light on Modern Human Endocranial Globularity. Current Biology 29(1): 120–27.

332

Mallick, S. et al. 2016. The Simons Genome Diversity Project: 300 Genomes from 142 Diverse Populations. Nature 538: 201–6.

333

Chen, L. et al. 2020. Identifying and Interpreting Apparent Neanderthal Ancestry in African Individuals. Cell 180(4): 677–87. Соотношения, установленные Чен и др., соответствуют низкому содержанию неандертальской ДНК, которое было отмечено ранее в других работах, например в проекте 1000 Genomes и в Prüfer, K. et al. 2014. The Complete Genome Sequence of a Neanderthal from the Altai Mountains. Nature 505(7481): 43–9.

334

Zammit, N. W. et al. 2019. Denisovan, Modern Human and Mouse TNFAIP3 Alleles Tune A20 Phosphorylation and Immunity. Nature Immunology 20: 1299–1310.

335

Almarri, M. et al. 2020. Population Structure, Stratification, and Introgression of Human Structural Variation. Cell 182: 189–99. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.024.

336

Wu, T. et al. 2005. Hemoglobin Levels in Qinghai-Tibet: Different Effects of Gender for Tibetans vs. Han. Journal of Applied Physiology 98(2): 598–604.

337

Niermeyer, S. et al. 1995. Arterial Oxygen Saturation in Tibetan and Han Infants Born in Lhasa, Tibet. New England Journal of Medicine 333: 1248–52.

338

Moore, L. G. 2001. Human Genetic Adaptation to High Altitude. High Altitude Medicine & Biology 2(2): 257–79.

339

Как и у многих белков, эта аббревиатура заключает в себе его полное закодированное название: эндотелиальный белок 1, содержащий домен PAS.

340

Huerta-Sánchez, E. et al. 2014. Altitude Adaptation in Tibetans Caused by Introgression of Denisovan-Like DNA. Nature 512: 194–7.

341

См. интервью с Эмилией Уэрта-Санчес от 29 мая 2019 г. на https://insitome.libsyn.com/natural-selection-and-deep-learning.

342

Yi, X. et al. 2010. Sequencing of 50 Human Exomes Reveals Adaptation to High Altitude. Science 329: 75–8.

343

Miao, B., Wang, Z. and Li, Y. 2017. Genomic Analysis Reveals Hypoxia Adaptation in the Tibetan Mastiff by Introgression of the Gray Wolf from the Tibetan Plateau, Molecular Biology and Evolution 34(3): 734–43.

344

Chen, N. et al. 2018. Whole-Genome Resequencing Reveals World-Wide Ancestry and Adaptive Introgression Events of Domesticated Cattle in East Asia. Nature Communications 9: 2337: https://doi.org/10.1038/s41467-018-04737-0; Wu, D.-D. et al. 2018. Pervasive Introgression Facilitated Domestication and Adaptation in the Bos Species Complex. Nature Ecology and Evolution 2: 1139–45.

345

Zhang, X. L. et al. 2018. The Earliest Human Occupation of the High-Altitude Tibetan Plateau 40 Thousand to 30 Thousand Years Ago. Science 362: 1049–51.

346

Racimo, F. et al. 2017. Archaic Adaptive Introgression in TBX15/WARS2. Molecular Biology and Evolution 34(3): 509–24.

347

Green, R. E. et al. 2010. A Draft Sequence of the Neandertal Genome. Science 328: 710–22.

348