Анатолий Клёсов - ДНК-генеалогия от А до Т

9

Mendez, F.L., Krahn, Т., Schrack, В., Krahn, А.-М., Veeramah, K.R., Woerner, A.E., Fomine, F.L.M., Bradman, N., Thomas, M.G., Karafet, T.M., Hammer, M.F. (2013) An African American paternal lineage adds an extremely ancient root to the human у chromosome phylogenetic tree. Am. J. Hum. Genet. 92,454–459.

10

http://www.lebialem.info/

11

Однонули – это носители гаплогруппы A0, африканской по нынешнему месту жительства. Где эта гаплогруппа образовалась – пока неизвестно. Датировка по гаплотипам дает ее «возраст» 180 тысяч лет, датировка по снипам не дана, видимо, потому, что данных пока мало. Мы приводим это здесь только для того, чтобы показать, насколько передним краем науки это сейчас является, и как много здесь пока неясностей. Но датировка по гаплотипам 180 тысяч лет для времени образования гаплогруппы A0 более надежна, во всяком случае пока.

В любом случае, гаплогруппы A00 и A0 пока являются древнейшими, и образовались до расхождения эволюционного (Y-хромосома) дерева человечества на африканскую и неафриканскую ветви. Нам этого для концептуальных рассмотрений ДНК-генеалогии человечества пока достаточно.

Однонулей, то есть носителей гаплогруппы A0, найдено в мире всего полтора десятка человек. Они рассеяны парами и тройками по субкладам A0,

12

https://www.familytreedna.com/public/Haplogroup_A/default. aspx?section=yresults

13

Scozzari, R., Massaia, A., DAtanasio, Е., Myres, N.M., Perego, U.A., Trombetta, В., & Cruciani, F. (2012) Molecular dissection of the basal clades in the human Y chromosome phylogenetic tree. PLoS ONE, 7, Article ID: e49170. http://dx.doi.org/10.1371/journal

14

Klyosov, А.А., Rozhanskii, I.L. (2012) Re-examining the “Out of Africa” theory and the origin of Europeoids (Caucasoids) in light of DNA genealogy. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 80-86

15

http://www.scirp.org/journal/HottestPaper.aspx?JournalID=737

16

Klyosov, А.А., Rozhanskii, I.L. (2012) Re-examining the “Out of Africa” theory and the origin of Europeoids (Caucasoids) in light of DNA genealogy. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 80–86.

17

Клёсов, А.А., Килин, В.В. (2015) Калькулятор Килина-Клёсова для расчета времен до общих предков (TMRCA): новое издание. Вестник Академии ДНК-генеалогии, т. 8, № 3, стр. 321–375.

18

http://dna-academy.ruAilin-klyosov/

19

Klyosov, А.А., Rozhanskii, I.L. (2012) Re-examining the “Out of Africa” theory and the origin of Europeoids (Caucasoids) in light of DNA genealogy. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 80-86

20

Klyosov, A.A., Rozhanskii, I.L. (2012) Re-examining the “Out of Africa” theory and the origin of Europeoids (Caucasoids) in light of DNA genealogy. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 80–86.

21

Юрковец, В.П. (2015) Климатическая катастрофа гаплогруппы «Бета». Вестник Академии ДНК-генеалогии, т. 8, № 3, стр. 376–432.

22

Юрковец, В.П. (2015) Климатическая катастрофа гаплогруппы «Бета». Вестник Академии ДНК-генеалогии, т. 8, № 3, стр. 376–432.

23

Groucutt, H.S., Petraglia, M.D., Bailey, G., Scerri, E.M., Parton, A., Clark-Balzan, L., Jennings, R.P., Lewis, L., Blinkhorn, J., Drake, N.A., Breeze, P.S., Inglis, R.H., Deves, M.H., Meredith-Williams, M., Boivin, N., Thomas, M.G., Scally, A. (2015) Rethinking the dispersal of Homo sapiens our of Africa. Evolutionary Anhropology, 24,149–164.

24

Behar, D.M., van Oven, M., Rosset, S., Metspalu, M., 100gvali, E.L., Silva, N.M., Kivisild, T., Torroni, A., Villems, R. (2012) A “Copernican” reassessment of the human mitochondrial DNA tree from its root. Amer. J. Human Genet. 90,675–684.

25

Groucutt, H.S., Petraglia, M.D., Bailey, G., Scerri, E.M., Parton, A., Clark-Balzan, L., Jennings, R.P., Lewis, L., Blinkhorn, J., Drake, N.A., Breeze, P.S., Inglis, R.H., Deves, M.H., Meredith-Williams, M., Boivin, N., Thomas, M.G., Scally, A. (2015) Rethinking the dispersal of Homo sapiens our of Africa. Evolutionary Anhropology, 24,149–164.

26

Behar, D.M., van Oven, М., Rosset, S., Metspalu, M., 100gvali, E.L., Silva, N.M., Kivisild, T., Torroni, A., Villems, R. (2012) A “Copernican” reassessment of the human mitochondrial DNA tree from its root. Amer. J. Human Genet. 90, 675–684.

27

http://www.yfull.eom/tree/B/

28

https://www.familytreedna.com/public/BYDNA/default. aspx?section=yresults

29

Клёсов, А.А., Саидов, Х.С. (2015) Евреи и пуштуны Афганистана. Концептуал, М., стр. 441–443.

30

http://www.isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpB.html

31

Barbieri, С., H ± 1bner, A., Macholdt, Е., Ni, S., Lippold, S., Schröder, R., Mpoloka, S.W., Purps, J., Roewer, L., Stoneking, M., Pakendorf, B. (2015) Refining the Y chromosome phylogeny with southern African sequences. bioRxiv, doi: http;dx.doi.org/10.1101/034983.

32

Barbieri, С., H ± 1bner, A., Macholdt, Е., Ni, S., Lippold, S., Schröder, R., Mpoloka, S.W., Purps, J., Roewer, L., Stoneking, M., Pakendorf, B. (2015) Refining the Y chromosome phylogeny with southern African sequences. bioRxiv, doi: http;dx.doi.org/10.1101/034983.

33

3 3. http://www.yfull. com/tree/С/

34

Seguin-Orlando, A., Korneliussen, T.S., Sikora, M., Malaspinas, A.-S., Manica, A., Moltke, I., A1brechtsen, A., Ко, A., Margaryan, A., Moiseyev, V., Goebel, T., Westaway, M., Lambert, D., Khartanovich, V., Wall, J.D., Nigst, P.R., Foley, R.A., Lahr, M.M., Nielsen, R., Orlando, L., Willerslev, E. (2014) Genomic structure in Europeans dating back at least 36,200 years. Supplementary Materials. Science, DOI: 10.1126/science.aaa0114

35

Nagle, N., Ballantyne, K.N., van Oven, M., Tyler-Smith, C., Xue, Y., Taylor, D., Wilcox, S., Wilcox, L., Turkalov, R., van Oorschot, R.A., McAllister, R, Williams, L., Kayser, M., Mitchell, R J. (2015) Antiquity and diversity of aboriginal Australian Y-chromosomes. Am. J. Phys. Anthropol. doi: 10.1002/ajpa.22886, October 30, 2015

36

Allentoft, М.Е., Sikora, М., Sjögren, K.G., Rasmussen, S., Rasmussen, M., Stenderup, J., Damgaard, P.B., Schroeder, H., Ahlström, T., Vinner, L., Malaspinas, A.S., Margaryan, A., Higham, T., Chivall, D., Lynnerup, N., Harvig, L, Baron, J., Della Casa, P., Dqbrowski, R, Duffy, P.R., Ebel, A.V., Epimakhov, A., Frei, К., Furmanek, M., Gralak, T.,et. al. (2015) Population genomics of Bronze Age Eurasia. Nature 522(7555), 167-72. doi: 10.1038/nature 14507.

37

Olalde, I., Allentoft, M.E., Sänchez-Ouinto, F., Santpere, G., Chiang, C.W.K., DeGiorgio, M., Prado-Martinez, J… Rodriguez, J.A., Rasmussen, S., Ouilez, J., Ramirez, O., Marigorta, U.M., Fernändez-Callejo, M., Prada, M.E., Encinas, J.M.V., Nielsen, R., Netea, M.G., Novembre, J., Sturm, R.A., Sabeti, R, Marques-Bonet, T., Navarro, A., Willerslev, E., Lalueza-Fox, C. (2014) Derived immune and ancestral pigmentation alleles in a 7,000-year-old Mesolithic European. Nature 507, 225–228.

38

Gamba, С., Jones, E.R., Teasdale, M.D., McLaughlin, R.L., Gonzalez-Fortes, G., Mattiangeli, V., Domboroczki, L., Kovari, I., Pap, I., Anders, A., Whittle, A. Dani, J., Raczky, P., Higham, T.F.G., Hofreiter, M., Bradley, D.G., Pinhasi, R. (2014) Genome flux and stasis in a five millennium transect of European prehistory. Nature Communs, DOI: 10.1038/ncomms6257

39

https://www.familytreedna.com/public/Chaplogroup/default. aspx?section=yresults

40

Klyosov, А.А. (2009) DNA Genealogy, mutation rates, and some historical evidences written in Y-chromosome. I. Basic principles and the method. J. Genetic Genealogy, 5,186–216.

41

Klyosov, A. A. (2012) Ancient history of the Arbins, bearers of haplogroup R1b, from Central Asia to Europe, 16,000 to 1500 years before present. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 87-105.

42

Адамов, Д.С., Клёсов, А.А. (2009) Определение возраста популяций по STR гаплотипам Y-хромосомы. Часть II. Погрешности расчетов. Вестник Российской Академии ДНК-генеалогии, т. 2, № 1, стр. 93-103; Адамов, Д.С., Клёсов, А.А. (2009) Определение возраста популяций по STR гаплотипам Y-хромосомы. Часть III. Примеры «линейных» и «квадратичных» моделей с учетом степени асимметрии мутаций. Вестник Российской Академии ДНК-генеалогии, т. 2, № 2, стр. 187–199; Klyosov, А.А. (2009) DNA Genealogy, mutation rates, and some historical evidences written in Y-chromosome. I. Basic principles and the method. J. Genetic Genealogy, 5,186–216; Klyosov, A.A. (2012) Ancient history of the Arbins, bearers of haplogroup R1b, from Central Asia to Europe, 16,000 to 1500 years before present. Advances in Anthropology, 2, No. 2, 87-105

43

Nagle, N., Ballantyne, K.N., van Oven, M., Tyler-Smith, C., Xue, Y., Taylor, D., Wilcox, S., Wilcox, L., Turkalov, R., van Oorschot, R.A., McAllister, R, Williams, L., Kayser, M., Mitchell, R J. (2015) Antiquity and diversity of aboriginal Australian Y-chromosomes. Am. J. Phys. Anthropol. doi: 10.1002/ajpa.22886, October 30, 2015

44

https://www.familytreedna.com/public/kirgiz/default. aspx?section=yresults

45

Zerjal, Т., Xue, Y., Bertorelle, G., Wells, R.S., Bao, W. et al. (2003) The Genetic Legacy of the Mongols. Am. J. Hum. Genet. 72, 717–721.

46

Там же.

47

https://www.familytreedna.com/public/Chaplogroup/default. aspx?section=yresults

48

https://www.familytreedna.com/public/Dhaplogroup?iframe=yresults

49

http://www.yfull. com/tree/D/

50

5 0. http://www.yfull. com/tree/Е/

51

Lacan, М., Keyser, C., Ricaut, F.-X. et al. (2011) Ancient DNA suggests the leading role played by men in the Neolithic dissemination. Proc. Natl. Acad. Sei. US, 108,18255-18259.

52

https://www.familytreedna.com/public/E3b?iframe=yresults

53

http://www.yfull.eom/tree/E/

54

Discussions. The mutation rate constants in DNA genealogy and related issues. Вестник Российской Академии ДНК-генеалогии, том 4, № 11, 2108–2195 (2011).

55

https://www.familytreedna.com/public/E3b?iframe=yresults

56

https://www.familytreedna.com/public/E-V13/default. aspx?section=yresults

57

Haak, W., Lazaridis, I., Patterson, N., Rohland, N., Mallick, S., Llamas, В., Brandt, G., Nordenfeit, S., Harney, E., Stewardson, K., Fu, O., Mittnik, A., Bänf-fy, E., Economou, C., Francken, M., Friederich, S., Pena, R.G., Hallgren, F., Khar-tanovich, V., Khokhlov, A., Kunst, M., Kuznetsov, P., Meller, H., Mochalov, 0., Moiseyev, V., Nicklisch, N., Pichler, S.L., Risch, R., Guerra, M.A.R, Roth, C., Szec-senyi-Nagy, A., Wahl, J., Meyer, M., Krause, J., Brown, D., Anthony, D., Cooper, A., Alt, K.W., Reich, D. (2015) Massive migration from the steppe is a source for Indo-European languages in Europe. Nature 522, 207–211.

58

Roewer, L., Willuweit, S., Kr ± 1ger, C., Nagy, M., Rychkov, S., Morozowa, L, Naumova, O., Schneider,Y., Zhukova, O., Stoneking, M., Nasidze, I. (2008) Analysis of Y chromosome STR haplotypes in the European part of Russia reveals high diversities but non-significant genetic distances between populations. Int J Legal Med., 122,219–223.

59

Balanovsky, О., Dibirova, К., Dybo, A., Mudrak, О., Frolova, S., Pocheshkhova, Е., Haber, М., Platt, D., Schurr, T., Haak, W., Kuznetsova, M., Radzhabov, M., Balaganskaya, O., Romanov, A., Zakharova, T., Hernanz S.D.F., Zalloua, R, Koshel, S., Ruhlen, M., Renfrew. C., Wells, R.S., Tyler-Smith, C., Balanovska, E. (2011) Parallel evolution of genes and languages in the Caucasus region. Mol Biol Evol. 28, 2905–2920.