Взломавшая код. Дженнифер Даудна, редактирование генома и будущее человечества - Уолтер Айзексон
48
Pollack. “Jennifer Doudna”.
49
Интервью автора с Лизой Туигг-Смит.
50
Jamie Cate… Thomas Cech, Jennifer Doudna, et al. “Crystal Structure of a Group I Ribozyme Domain: Principles of RNA Packing” // Science, 20 сентября 1996 г. О первом значительном шаге в исследовании Боулдера см. в работе: Jennifer Doudna and Thomas Cech. “Self-Assembly of a Group I Intron Active Site from Its Component Tertiary Structural Domains” // RNA, март 1995 г.
51
NewsChannel 8 report, “High Tech Shower International”. YouTube, 29 мая 2018 г., https://www.youtube.com/watch?v=FxPFLbfrpNk&feature=share.
52
Cate et al. “Crystal Structure of a Group I Ribozyme Domain.”
53
Интервью автора с Джейми Кейтом и Дженнифер Даудной.
54
Andrew Fire… Craig Mello, et al. “Potent and Specific Genetic Interference by Double-Stranded RNA in Caenorhabditis elegans” // Nature, 19 февраля 1998 г.
55
Интервью автора с Дженнифер Даудной, Мартином Йинеком и Россом Уилсоном; Ian MacRae, Kaihong Zhou… Jennifer Doudna, et al. “Structural Basis for Double-Stranded RNA Processing by Dicer” // Science, 13 января 2006 г.; Ian MacRae, Kaihong Zhou, and Jennifer Doudna. “Structural Determinants of RNA Recognition and Cleavage by Dicer” // Natural Structural and Molecular Biology, 1 октября 2007 г.; Ross Wilson and Jennifer Doudna. “Molecular Mechanisms of RNA Interference” // Annual Review of Biophysics, 2013; Martin Jinek and Jennifer Doudna. “A Three-Dimensional View of the Molecular Machinery of RNA Interference” // Nature, 22 января 2009 г.
56
Bryan Cullen. “Viruses and RNA Interference: Issues and Controversies” // Journal of Virology, ноябрь 2014 г.
57
Ross Wilson and Jennifer Doudna. “Molecular Mechanisms of RNA Interference” // Annual Review of Biophysics, май 2013 г.
58
Alesia Levanova and Minna Poranen. “RNA Interference as a Prospective Tool for the Control of Human Viral Infections” // Frontiers of Microbiology, 11 сентября 2018 г.; Ruth Williams. “Fighting Viruses with RNAi” // The Scientist, 10 октября 2013 г.; Yang Li… Shou-Wei Ding, et al. “RNA Interference Functions as an Antiviral Immunity Mechanism in Mammals” // Science, 11 октября 2013 г.; Pierre Maillard… Olivier Voinnet, et al. “Antiviral RNA Interference in Mammalian Cells” // Science, 11 октября 2013 г.
59
Перевод И. К. Брусиловского.
60
Yoshizumi Ishino… Atsuo Nakata, et al. “Nucleotide Sequence of the iap Gene, Responsible for Alkaline Phosphatase Isozyme Conversion in Escherichia coli” // Journal of Bacteriology, 22 августа 1987 г.; Yoshizumi Ishino et al. “History of CRISPR-Cas from Encounter with a Mysterious Repeated Sequence to Genome Editing Technology” // Journal of Bacteriology, 22 января 2018 г.; Carl Zimmer. “Breakthrough DNA Editor Born of Bacteria” // Quanta, 6 февраля 2015 г.
61
Интервью автора с Франсиско Мохикой. При подготовке этого раздела также использовались работы Kevin Davies. “Crazy about CRISPR: An Interview with Francisco Mojica” // CRISPR Journal, 1 февраля 2018 г.; Heidi Ledford. “Five Big Mysteries about CRISPR’s Origins” // Nature, 12 января 2017 г.; Clara Rodríguez Fernández, “Interview with Francis Mojica, the Spanish Scientist Who Discovered CRISPR” // Labiotech, 8 апреля 2019 г.; Veronique Greenwood. “The Unbearable Weirdness of CRISPR” // Nautilus, март 2017 г.; Francisco Mojica and Lluis Montoliu. “On the Origin of CRISPR-Cas Technology” // Trends in Microbiology, 8 июля 2016 г.; Kevin Davies. Editing Humanity (Simon & Schuster, 2020).
62
Francesco Mojica… Francisco Rodriguez-Valera, et al. “Long Stretches of Short Tandem Repeats Are Present in the Largest Replicons of the Archaea Haloferax mediterranei and Haloferax volcanii and Could Be Involved in Replicon Partitioning” // Journal of Molecular Microbiology, июль 1995 г.
63
Электронное письмо от Руда Янсена Франсиско Мохике, 21.11.2001.
64
Ruud Jansen… Leo Schouls, et al. “Identification of Genes That Are Associated with DNA Repeats in Prokaryotes” // Molecular Biology, 25 апреля 2002 г.
65
Интервью автора с Франсиско Мохикой.
66
Sanne Klompe and Samuel Sternberg. “Harnessing ‘a Billion Years of Experimentation’” // CRISPR Journal, 1 апреля 2018 г.; Eric Keen. “A Century of Phage Research” // Bioessays, январь 2015 г.; Graham Hatfull and Roger Hendrix. “Bacteriophages and Their Genomes” // Current Opinions in Virology, 1 октября 2011 г.
67
Rodríguez Fernández. “Interview with Francis Mojica”; Greenwood. “The Unbearable Weirdness of CRISPR”.
68
Интервью автора с Франсиско Мохикой; Rodríguez Fernández. “Interview with Francis Mojica”; Davies, “Crazy about CRISPR”.
69
Francisco Mojica… Elena Soria, et al. “Intervening Sequences of Regularly Spaced Prokaryotic Repeats Derive from Foreign Genetic Elements” // Journal of Molecular Evolution, февраль 2005 г. (получено 6 февраля 2004 г.; принято 1 октября 2004 г.).
70
Kira Makarova… Eugene Koonin, et al. “A Putative RNA-Interference-Based Immune System in Prokaryotes” // Biology Direct, 16 марта 2006 г.
71
Интервью автора с Джиллиан Бэнфилд и Дженнифер Даудной; Doudna and Sternberg. A Crack in Creation. P. 39; “Deep Surface Biospheres”. Banfield Lab page, Berkeley University website.
72
Совместное интервью автора с Джиллиан Бэнфилд и Дженнифер Даудной.
73
Интервью автора с Дженнифер Даудной.
74
Интервью автора с Блейком Виденхефтом и Дженнифер Даудной.
75
Kathryn Calkins. “Finding Adventure: Blake Wiedenheft’s Path to Gene Editing” // National Institute of General Medical Sciences, 11 апреля 2016 г.
76
Emily Stifler Wolfe. “Insatiable Curiosity: Blake Wiedenheft Is at the Forefront of CRISPR Research” // Montana State University News, 6 июня 2017 г.
77
Blake Wiedenheft… Mark Young, and Trevor Douglas. “An Archaeal Antioxidant: Characterization of a Dps-Like Protein from Sulfolobus solfataricus” // PNAS, 26 июля